嘌呤的人体代谢
人体内嘌呤分解代谢的最终产物是尿酸。其他哺乳动物有尿酸氧化酶和排泄更可溶性的尿囊素作为最终产品。人类没有这种酶，所以尿酸是我们的最终产品。尿酸主要在肝脏中形成，并由肾脏排泄到尿液中。
从核苷酸到碱基
鸟嘌呤核苷酸水解为鸟苷，后者与鸟嘌呤和核糖1-p发生磷酸化作用。然而，人的细胞内核苷酸酶对amp不是很活跃。相反，amp被腺苷酸(amp)脱氨酶脱胺为imp（肌苷酸）。在嘌呤核苷酸的降解过程中，imp被核苷酸酶水解为肌苷，然后磷酸化为次黄嘌呤进一步降解。
腺苷通常在转甲基化反应过程中由s-腺苷甲硫氨酸产生。腺苷被腺苷脱氨酶脱氨为肌苷。腺苷脱氨酶或嘌呤核苷磷酸化酶缺乏导致两种不同的免疫缺陷疾病，其机制尚不清楚。腺苷脱氨酶缺乏会影响t细胞和b细胞的免疫功能。磷酸化酶缺乏影响t细胞，但b细胞正常。1990年9月，一名4岁女孩因腺苷脱氨酶缺乏症接受了基因工程治疗，在她的细胞内加入了该基因。到目前为止，治疗似乎是成功的。
甲基化嘌呤是否被分解代谢取决于甲基的位置。如果甲基在-nh2上，它就会和-nh2一起被移除，核心就会以通常的方式进行代谢。如果甲基在氮环上，化合物在尿液中排泄时不会发生变化。
从碱基到尿酸
腺苷酸和鸟苷酸共同的中间体为黄嘌呤。从腺嘌呤转化而来的次黄嘌呤被黄嘌呤氧化酶氧化为黄嘌呤。鸟嘌呤被脱氨，氨基释放为氨，生成黄嘌呤。如果这一过程发生在肝脏以外的组织中，大部分氨将以谷氨酰胺的形式运输到肝脏，最终以尿素的形式排出体外。
黄嘌呤和次黄嘌呤一样，被氧和黄嘌呤氧化酶氧化，产生过氧化氢。在人体内，尿酸被排出，过氧化氢被过氧化氢酶降解。黄嘌呤氧化酶仅在肝脏和肠道中存在显着浓度。许多组织中都存在通往核苷(也可能是游离碱基)的通路。
综上所述，除了环甲基化外，所有嘌呤都被脱胺(氨基构成了一般的氨池)，环被氧化成尿酸用于排泄。由于嘌呤环的排泄是完整的，这些碳不会给人类带来任何能量。
嘧啶的分解代谢
与嘌呤形成对比的是，嘧啶发生环裂，通常分解代谢的最终产物是β-氨基酸加上氨和二氧化碳。核苷酸酶和嘧啶核苷磷酸化酶作用于核酸或能量池中的嘧啶，产生游离碱基。胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的4-氨基以氨的形式释放。
嘧啶环的裂解
为了使环被切割，它们必须首先被nadph还原。两个环的原子2和3都以氨和二氧化碳的形式释放出来。环的其余部分以β-氨基酸的形式存在。从胸腺嘧啶或5-甲基胞嘧啶中排出β-氨基异丁酸酯。来自胞嘧啶或尿嘧啶的β-丙氨酸可以被排泄或结合到大脑和肌肉二肽，肌肽(his-β-ala)或鹅肌肽(甲基his-β-ala)。
没有被降解的嘌呤和嘧啶碱基被人体回收，即重新结合成核苷酸。然而，这种循环利用并不足以满足人体的全部需求，因此一些从头合成是必不可少的。人体各组织在进行从头合成的能力上有明显的差异。嘌呤的从头合成在肝脏中最活跃。其他组织通常具有有限的或甚至没有从头合成的能力。嘧啶合成发生在各种组织中。对于嘌呤，特别是非肝组织，严重依赖于预先形成的碱基——这些碱基从人体自身的细胞内循环中回收，辅以在肝脏中合成并通过血液传递到组织的碱基。
在大多数细胞中，嘌呤的“回收”是合理的，因为黄嘌呤氧化酶是将嘌呤全部转化为尿酸的关键酶，它只在肝脏和肠道中具有显著的活性。非肝组织中周转产生的碱基在这些组织中不容易降解为尿酸，因此可用于回收。肝脏可能进行较少量的回收，但在从头合成的过程中非常活跃，而且不是为了自身，相反是为了帮助供应周围组织。
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